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樣品類型
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注意事項(xiàng)
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細(xì)菌
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1.通用載體或自己構(gòu)建的載體,都請注明載體名稱、抗生素類型以及具體測序引物。
2.我們提供Amp,Kan,Tet及Chl四種抗生素;特殊抗性、特殊培養(yǎng)條件的樣品,請您提供已經(jīng)培養(yǎng)好的5ml新鮮菌液或沉淀好的菌體。
3.如果是病毒(包括噬菌體)DNA,低拷貝質(zhì)粒以及BAC DNA,請您純化好模板直接用于測序。
4.建議您提供穿刺菌。如果是菌液則必須是新鮮的;加甘油后冷凍保存的菌株請您復(fù)蘇后再提供。
5.樣品太少會導(dǎo)致培養(yǎng)時(shí)間過長甚至出現(xiàn)培養(yǎng)細(xì)菌失敗,以至延誤您的實(shí)驗(yàn),所以提供的菌液至少200ul以上。
6.務(wù)必注明是否有特殊結(jié)構(gòu):GC rich;GC cluster、Poly(A)、Poly(T)、重復(fù)序列及引物同源序列等。
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質(zhì)粒
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1.為確保測序的成功率和質(zhì)量,建議您盡量提供菌種測序。
2.因特殊原因只能提供質(zhì)粒模板測序時(shí),必須保證質(zhì)粒是高純度的,而且須溶解在滅菌的去離子水中而不是TE中。濃度大于100ng/ul,體積10ul以上,注明抽提方法。
3.如果是病毒(包括噬菌體)DNA,低拷貝質(zhì)粒以及BAC DNA,請純化好模板直接用于測序。
4.插入片段有特殊結(jié)構(gòu)時(shí)必須注明,特別是含有通用引物的同源序列。
5. 務(wù)必注明是否有特殊結(jié)構(gòu):GC rich;GC cluster、Poly(A)、Poly(T)、重復(fù)序列及引物同源序列等。
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PCR產(chǎn)物
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1.原則上收取高質(zhì)量的PCR原液, 片段大小為200~1500bp。
2.取3ul原液電泳檢測,為明亮單一條帶。
3.提供未純化產(chǎn)物測序,PCR原液不少于50ul;須注明產(chǎn)物的體積、片段大小、濃度,是否經(jīng)過Agarose膠純化。
4.提供已純化的產(chǎn)物測序,體積不少于15ul,PCR產(chǎn)物須溶解在滅菌的去離子水中而不是TE中;注明提供PCR產(chǎn)物的體積、片段大小、濃度,是否經(jīng)過Agarose膠純化。
5.提供的測序引物,濃度不低于5pmol/ul(5umol/L),要求PAGE純化,體積15ul以上,樣品多將適當(dāng)增加量。
6. 務(wù)必注明是否有特殊結(jié)構(gòu):GC rich;GC cluster、Poly(A)、Poly(T)、重復(fù)序列及引物同源序列等。
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備注
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我們?yōu)槟峁┑拿赓M(fèi)通用測序引物信息。
2.隨機(jī)引物(RAPD)、含簡并堿基或長度小于15的引物不適合用于測序。
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